Как перенести цитаты на компьютер?

Немного не в тему, но: пришлось форматировать устройство и пропали заметки с книги, хранящейся не в облаке. «Annotation backup» было включено, могли ли они сохраниться где-то?

Пользовательские цитаты хранятся локально в файле Clippings (директория «documents»).
Соответственно, если вы этот файл уничтожили, то… забудьте о них.

Резервное копирование работает только для облачного контента.
Т.е. для файлов, которые были отправлены через Send to Kindle.