После установки 5.3.3. :
​Установленные на предыдущей версии шрифты сохранились, русские словари и доступ​ к ним (не через Cool Reader) присутствует.
Переносов слов - вроде бы, нет (допроверяю ещё).

​Пожалуйста, расшифруйте​ слово "сохраняется".
В каком смысле?
После обновления до 5.3.3 у меня после попытки вызова Cool Reader выскакивает сообщение, что для этого нужен JailBreak.
Могу ли я ЗАНОВО установить текущую версию JailBreak?

​Известный закон Мёрфи (из "Физики шутят") звучит так: "Если что-то может испортиться, оно испортится!". Русский вариант просто говорит о "законе подлости".
Правда, Мёрфи сформулировал следствие из этого закона ещё краше: "Если ничего не может испортиться, оно испортится всё равно!"

Как бывший руководитель проекта я когда-то переиначил всё это на определённый тип конструкторов, с которыми мы иногда косвенно сталкиваемся в жизни через их изделия.
Этот закон звучит примерно так: "Если в модификации проверенной и надёжной конструкции что-то можно испоганить, её испоганят!"
И соответствующее следствие из этого закона: "Если в проверенной и надёжной конструкции ничего нельзя испоганить, её испоганят всё равно!"

Разработчик калькулятора в предлагаемом наборе инструментов для Киндл принадлежит именно к этому ТИПУ конструкторов. У меня для него (на случай встречи) в столе имеется лишь напильник для заточки пальцев, дабы они - пальцы - уже никогда бы не прикасались к разработке чего бы то ни было.

Впрочем, конструкторы других инструментов из предлагаемого набора довольно успешно борятся с "лидером" за право никогда не прикасаться к разработкам.

Повторяю: если в этих известных всему миру инструментах можно было хоть что-то испоганить, они справились с задачей успешно.

​​​​​Для очередной редакции Cool Reader предлагаю взять на заметку исправление некоторых неудобств при выборе файла для чтения (для открытия файла).

1) Если список длинный, и он упирается в нижнюю границу экрана, то выбрать для чтения именно этот - последний на видимой части экрана - файл, довольно-таки затруднительно. Трудно сделать правильное касание, тем более - два правильных касания.

2) В списке фигурирует множество папок с расширением .sdr которые не только бесполезны для читателя, но и вводят в некоторое заблуждение из-за того, что основное имя этих папок соответствует имени реальной книги в устройстве (соответствует имени - но не содержанию).
В общем, предложение такое: Cool Reader не должен показывать в списке того, с чем он не может работать.

3) Когда на экране список файлов (и папок) для отыскания и открытия нужной книги, то описанные действия при касании различных частей экрана скорее вводят в заблуждение, чем помогают. Лично я научаюсь работать со списком на экране, как "собака Павлова". [И тут я иногда жалею, что устройство для ускоренного обучения, - при неправильном касании, - не "действует на меня током в 600v", хотя Киндлера я прекрасно могу понять - ему немного не хватает мощности аккумулятора в ридере. Думаю, что американцы вполне могли бы пойти навстречу решению этой проблемы - это с ихнем-то многолетним опытом применения электрических стульев. :) ]

Я, оказывается, знаю магическое слово - "вроде бы".​
Выше я написал совершенно точно: "Вроде бы сделал всё точно по инструкции". Самое точное в этом выражении - "Вроде бы..."

Дело в том, что под перезагрузкой я понимал аккуратное отключение USB-устройства от компьютера в Windows 7 с последующим отсоединением USB-кабеля И ПОЛНЫМ ВЫКЛЮЧЕНИЕМ устройства (6 сек. удержания кнопки).

Однако, перезагрузка, как потом до меня дошло, это то, что в меню называется Restart.
Теперь всё работает, шрифты видны.

Хотя я до сих пор не понимаю выражения в инструкции "При использовании KF8-файлов..."
Каким образом я - пользователь - работаю с KF8-файлами. Я конечно обнаружил соответствующий фолдер в киндле, но, уж извините, прикасаться к этим файлам "своими грязными лапами" совесть не позволяет.

P.S.
Предлагаю третий пункт инструкции:

3. После перезагрузки шрифты будут доступны для выбора в меню «Аа».

Заменить на такой:
3. Шрифты будут доступны после перезагрузки: Menu>Settings>Menu>Restart

​Насколько я понимаю, за снятие защиты с книг купленных именно с этим антипиратским атрибутом, "гардероб отвестсвенности не несёт". Там продолжают действовать общие киндлевские правила.
Насчет переносов, то в объяснении автора (см.топик) сказано: "расстановка переносов в книгах mobi/azw".
У меня после установки patch переносы в этих форматах расставлются. В azw3 - нет. Но это и не было обещано.
Впрочем, профи наверное скажет вам поточнее.

​У меня версия 5.3.1 и подсветка гаснет без всяких задержек.
Версию 5.3.0. не пробовал, т.к. мой Kindle родился уже с 5.3.1.

А счастье было так близко! :)
Но всё же, спортивный интерес заедает!
Если у вас появятся какие-нибудь подозрения (кроме судьбы), то просьба - поделитись. Принимаю любые, даже конспирологические, версии​.

Системные - это те, которые были до того?
Они не исчезали. Вроде бы всё, как обычно.
Пробовал и другие шрифты, а также ​те, что по указанной вами ссылке (http://db.tt/ilV6LePt).
Однако, всё остаётся в точности, как было ДО этих изменений - нажатие Aa выдаёт на экран стандарный киндлевский набор шрифтов и опций.

​Прошивка 5.3.1. Вроде сделал всё точно по инструкции.
Скопировал в папку fonts на Kindle свой любимый шрифт Calibri (TFT: обычный, наклонный, жирный и жирный наклонный) прямо из Windows.
Аккуратно отключил устройство, потом полностью выключил (до пустого экрана).
Тем не менее, список шрифтов остался прежним (фирменным).
Устройство, по сравнению с заводской прошивкой, имеет только Jailbreak и JBPatch (переносы для mobi/azw и пр.).
Какие могут быть причины?