Your comments
Это нормально, происходит переформатирование всей книги с новым разбиением на страницы, особенность crengine. Чем больше книга, тем дольше.
Все пункты из шапки темы.
Следовать инструкциям.
Обновите на последнюю версию. Jailbreak делается легко.
Вот здесь оригинальная инструкция по установке с файлами с сайта проекта.
update_cr3runner_2.7_install-k4.bin должен быть в корне, а не в documents, вы не туда скопировали файлы, читайте инструкцию внимательнее, копировать всё из архива нужно в корень.
После этого сделать Home > Menu > Settings > Menu > Update Your Kindle.
Про колонтитул ответил выше.
Колонтитул и footnotes -- это разные вещи. Колонтитул:
Key_Select = CMD_TOGGLE_HEADER (keymaps.ini).
Код: 0x01010000 (keydefs.ini).
Доступно только из настроек.
Customer support service by UserEcho
У меня на тестовом Kindle Touch прошивка 5.1.2, версия Cool Reader отсюда работает нормально. Гарантировать работу на других прошивках или при установке из других источников я не могу. По вопросам обновления прошивки пишите в профильные темы, здесь обсуждается только Cool Reader.