У меня тоже не отображались книги в Киндл после загрузки книг с компьютера,  но я просмотрела ответы здесь и вняла одному совету, после чего проблема решилась. У меня Киндл не отображает книги в формате HTML, word, pdf и других,  кроме TXT. В текстовом формате устройство видит книги. Так что создаю файлы в этом формате и отправляю их в папку documents.